我国在对外专利申请方面与美、日、韩等国相比差距明显。比如，我国对外专利申请量和授权量的绝对数量少，与美、日、欧、韩等国家或地区之间在交叉专利申请量和授权量上存在巨大逆差，同时，我国对外专利申请的产出率低、申请质量有待于进一步提高、对外专利申请优势行业和优势企业不足、对PCT制度的利用水平相对较低。
研究表明，影响和制约我国对外专利申请的因素主要包括以下几个方面：
国内企业参与全球技术竞争的程度较低
调查研究显示，海外市场的需求是影响企业和创新主体是否向海外寻求专利保护并提交专利申请的主要因素。从企业市场经营行为的角度来看，企业是否参与全球技术竞争是企业是否寻求海外专利申请保护的根本原因。
目前我国仅有极少数企业充分参与到全球竞争中，而其中有实力与国外企业进行技术竞争的更是凤毛麟角。一方面，我国出口贸易以资源贸易和贴牌加工为主，多数企业在全球产业链中处于中低端，与处于产业链高端的各大跨国公司并不产生直接的技术竞争；另一方面，我国企业的海外投资数量较少，在海外保护其经济利益的诉求不强，截至2002年底，我国对外投资累计达350亿美元，仅相当于日本的1%，美国的5‰。随着能源和原材料价格的快速上涨以及人力成本的不断提高，我国企业所拥有的比较优势将逐渐消失。因此，促使企业提高以技术创新和知识产权为核心的竞争力，是提升我国对外专利申请数量和质量的首要前提。
国内市场主体创新能力有限
由于进行核心技术研发、取得基础性专利通常需要大量研发资金投入，且难以在短期内产生实效，这在一定程度上影响了企业进行基础性核心技术、前沿技术研发的积极性，导致在我国大部分企业提交的专利申请中基础性发明创造少，缺乏核心专利，技术含量不高，从根本上制约了我国对外专利申请质量的提升。
以国资委所属企业这一我国进行对外贸易、参与全球竞争的主要群体为例，2007年，国资委所属企业共申请发明专利1.1万件，仅占全国发明专利申请总量的4.5%；截至2007年底，国资委所属企业累计获得有效专利4万多件，其中有效发明专利仅1.5万件。可见，这些在国内实力相对雄厚的企业在专利申请的数量、质量上均有较大提升空间。
国内创新主体对外申请专利的意识亟待提高
专利权作为企业市场经营、可持续发展的竞争武器和藉以获得高额市场收益的无形资产，其重要作用尚未被我国多数专利申请人充分意识到。
首先，由于我国多数大型企业对专利申请工作重视程度不够，在知识产权人才和资金方面的投入不足，不仅影响企业的知识产权和专利申请工作，使企业的技术创新成果不能有效转化为专利进而融为企业竞争力的有机组成部分，而且可能导致企业的技术创新成果白白在海外投资地、经营地流失，严重影响了企业的可持续发展和核心竞争力的提升。其次，我国大专院校、科研院所仍存在重论文发表、轻专利申请的现象，部分研究机构还局限于将专利申请视作一种研究成果，在申请质量和授权后的维持和保护等方面还明显存在诸多不足。
对外专利保护信息获取困难
我国专利申请人缺少获取对外专利申请信息的有效渠道，不能有效掌握各国专利保护状况、申请程序、诉讼方式和转化途径等信息。
作为企业开拓海外市场的一个重要前提，企业一般应了解可能成为其海外市场的各有关国家或地区的知识产权保护环境以及专利制度运行情况，以确定是否进入市场、如何进入市场、是否申请专利以保护其在目标市场的正常经营和合法权益。但从目前我国提供对外专利申请保护信息的现状看，还不能满足企业的基本需要。
首先，缺乏不同市场的专利保护信息。对美、日、欧、韩等市场，我国虽然已经为社会公众提供了一定的专利申请程序信息，但在如何应诉、维权和如何转化、收益等方面还缺乏全面、权威的信息；对于大多数发展中国家市场或边缘市场，企业连基本的申请程序和保护状况信息都不甚了解，尤其是对东南亚、非洲、中欧等市场。
其次，专利保护信息获取渠道不畅。目前我国国内提供世界各国、地区知识产权制度信息、保护信息的现有渠道和平台还难以做到全面、系统、动态、实时，高度匹配企业实际需求的信息供给渠道更是匮乏，导致国内企业在具有对外专利申请需求时，往往难以获取相关市场的专利保护信息，有些信息即便通过目标市场所在国的专利代理事务所也不能有效获得。
高端专业人才短缺
当前，熟悉对外专利申请事务的高端专业人才严重不足，成为制约我国对外专利申请工作的重要“短板”。无论是在专利代理机构，还是在企业内部，都急需培养相应的专业人才。
一方面，专利代理事务所的人才培养力度有待加强。目前，我国虽然已经有了近万人的专利代理队伍，但与庞大的市场需求相比，人力资源仍然严重不足。大部分专利代理人从业经历较短、业务水平较低，不能满足专利申请人制定实施全球化专利申请策略的需要。
另一方面，企业内部同样缺乏知识产权专业人才。目前，我国大部份企业没有专业的知识产权机构，少数企业即使设立了相应机构，人员也严重不足，而且，现有的知识产权工作人员在多数企业内部待遇相对较低，发展空间有限，接受培训和再教育的机会较少，限制了企业知识产权人才队伍的发展。
对外专利申请成本高昂
影响我国专利申请人对外申请专利的一个重要因素是对外专利申请过程中所需的高额费用。目前，无论是从专利申请人的经济承受能力，还是从政府的申请资助水平看，向国外申请专利的费用成本都过于高昂，大多企业很难承受。据统计，通过巴黎公约获得1件对外专利申请授权至少需要数万元人民币。此外，对外专利申请经常需要经历申请、审查、复审、异议等多个程序才能获得授权，除了要向有关国家专利局缴纳基本专利申请费用外，还需要向接受委托的专利代理机构或律师事务所支付相当于基本费用6倍至10倍的代理律师费。
这些费用与我国绝大多数企业的营业额、利润率相比，显得过于高昂。虽然已经有部分企业制定实施了对外专利申请的战略规划，并投入了对于企业而言相当可观的专利申请专项资金，但实际能够提交的专利申请仍然有限。调查表明，企业即便每年拿出1000万人民币进行专利申请，也仅能申请20件至30件PCT，而这种规模的费用成本对于中小企业而言基本无法承受。
对外专利申请获权不确定性较高
在专利申请人进行对外专利申请的过程中，可能抑制其申请积极性的一大因素是对外专利申请获权的不确定性。
首先，对外专利申请的授权前景不明朗。一方面，对外专利申请在各个专利局进入审查阶段后，将由各局审查员按照各自的专利法律法规和标准进行审查，相同发明内容的专利申请在不同的国家有可能最终获得不同的审查结果；另一方面，对外专利申请程序较为复杂，这不仅构成了专利申请行为的障碍，而且大大增加了在申请程序上出现差错以至丧失权利的几率。
其次，对外专利申请的审查周期难以预期。主要体现在各国家或地区专利局由于专利申请案件的积压程度不同、人力资源和审查能力不一、技术领域分布不均衡等因素，导致各专利局的审查速度存在差异，使得专利申请人的市场经营行为因审查周期难以预期而受到一定影响。
国内申请人运用专利的能力和水平亟待提高
获得专利授权不是专利申请人申请专利的最终目的，只有使专利技术产业化、对专利权进行许可或转让，才能够使技术创新主体通过专利保护制度获益，实现技术创新、专利申请、转化获益的良性循环。跨国公司一方面利用专利获取直接经济利益，主要途径包括专利技术的直接产业化实施、对外投资生产、产品出口、专利权的许可和转让等；另一方面，通过建立专利联盟等方式提升企业在有关技术领域及市场的竞争力和垄断地位，将专利纳入技术标准以进一步扩大专利权的技术控制力和经济控制力，占据并巩固企业在行业中的竞争优势，已经成为国外企业战略性运用专利的常见手段和方式。
与国外企业尤其是跨国公司相比，我国企业在专利运用方面还明显处于落后状态。重市场轻创新、重申请轻运用、重实施轻运营，已经使国内企业付出了沉重的代价。在未来，国内企业不仅需要加强技术创新，更应积极提高运用专利制度的水平，加强专利向标准的转化，提高企业专利战略意识，并且跟踪研究竞争对手的专利发展动态，为维护自身市场利益做好专利保障，进而支持技术创新谋求更有利的市场竞争地位。
